טיפול שורש הוא התהליך שבו רופא השיניים (מומחה לטיפולי שורש) מסלק את תכולת מוך השן שהזדהמה בחיידקים, מעצב ומנקה את החלל הזה באופן מיטבי.  בסיום טיפול השורש מערכת תעלות השורש מלאות בסתימת שורש קבועה.
 
מטרת הטיפול הינו שמירה על השן לטווח ארוך ללא זהום בתוכו.
 
טיפול שורש טוב הינו הבסיס לכל תהליך שיקום הפה. כשלון של טיפול השורש אלול לגרום לזיהומים חוזרים, אובדן שיניים  וכשלון של עבודת השיקום.