אפיסקטומי הינו אחד הטיפולים האפשריים לטיפול בטיפול שורש כושל.
 
כשטיפול שורש נכשל נוצר מצב זיהומי מתמשך שיכול להיות מלווה התפרצויות של כאבים ונפיחויות. מצבים אלו מטופלים אנטיביוטית, לעיתים כירורגית ויתכן צורך בטיפול באשפוז.
 
חשוב לאבחן כשלון של טיפולי שורש טרם ההתפרצויות הללו. לשם כך יש צורך בבדיקה תקופתית אצל רופא השיניים שיכלול צילומי רנטגן.
 
אחד הטיפולים בטיפול שורש כושל הינו אפיסקטומי: זה הליך כירורגי זעיר (כירורגיה אנדודונטלית) בה מתבצע קיטום קצה השורש, ניקוי סתימת השורש מחלקו התחתון וסילוק הדלקת . סיום הטיפול  בסתימת קצה השורש. לכירורגיה האנדודונטלית המודרנית אחוזי הצלחה גבוהים בהשוואה לטכניקה המיושנת בזכות השימוש במיקרוסקופ הדנטלי שמשפר את תהליך האבחנה והטיפול .
 
האפיסקטומי מתבצעת על ידי ד"ר לוין, מומחית לטיפולי שורש, יחד עם ד"ר קריינר, המומחה לכירורגיה של הפה והלסתות,  תוך כדי שימוש במיקרוסקופ הטיפולי ויתר המיכשור המודרני היעודי למטרה זאת. וזאת על מנת להסיג את התוצאות הטובות ביותר.